随着科技的发展，生产肽的方法也在不断发展。
1. 五六十年代，主要是从动物脏器获取肽。如胸腺肽，其生产方法是将刚生下来的小牛宰杀之后，割下其胸腺，然后用震荡分离的生物技术，将小牛胸腺中的肽震荡分离出来，制成胸腺肽针剂。这种胸腺肽主要用于人体免疫。目前，这种肽已处于淘汰状态。因现在世界上流行“疯牛病”,这种病毒主要吞噬动物大脑中的蛋白质，破坏其脑组织、细胞及神经。人体一旦染上此病毒，比患上癌症还可怕，最终成为“植物人”或很快死亡。还有从人体血液中提炼出来的肽 ,其副作用也很大，它不仅容易使人体染上甲肝、乙肝、丙肝、丁肝、艾滋病毒、性病病毒，而且有排异过敏反应，这种反应一旦出现，生命就危在旦夕。
2. 世界上有固相合成法、液相合成法生产的肽。用这种方法生产肽的企业在美国硅谷就有一家。他们主要是购买世界上一些精细化工厂生产的氨基酸为原料定向合成某种单肽，属医药原料中间体，主要用于西药配方，以增强药效、增强人体对药的吸收速度和吸收率。
3. 酸解法或碱解法生产的多肽。这种肽主要出现在日本。日本不二油脂株式会社，用酸解法生产的“大豆多肽”,属“食品添加剂”,主要用于老人和儿童食品，其目的是增强这两种人群对食品营养的吸收。现在，世界上拥有“大豆多肽”的国家只有日本和中国。但其所用的原料、水解法和产品性质大有不同。日本不二油脂株式会社所用原料是豆粕，水解方法是酸法，生产的肽酸性化学物质难以除尽，而且有苦味，需用活性炭吸附、脱苦，而活性炭免不了会侵入肽体。
4. 酶法生产的生物活性肽。这种肽主要产在中国，代表着当今世界肽研究、开发、生产、创新的水平和潮流。酶法生产的生物活性肽是用人体所需要的食品级植物蛋白酶，将人体平常所食的食物蛋白质酶解成小分子活性多肽。它具有极强的生物活性和多样性，已在世界范围内引起关注，成为当今世界追崇的热点。如武汉九生堂生产的“大豆多肽”,所用原料是含量在90%以上的大豆分离蛋白，水解方法是酶法，所用的酶属食品级植物蛋白酶。生产的“大豆多肽”无苦味，且风味芳香宜人，对人体无任何毒副作用。产品属终端产品，被中国创新基金列为无偿资助项目，现在已实现工业化生产，其终端产品“大豆多肽”口服液是世界上第一个用酶法生产的大豆多肽终端产品，在第89届广交会上受到世界客商的青睐。